Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms