Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCAQ16586 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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