Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK3Q16288 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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