Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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