Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECTIN1Q15223 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NECTIN1Q15223 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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