Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNIP1Q15025 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms