Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMC1AQ14683 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms