Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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