Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPP1R1AQ13522 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms