Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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SEMA3FQ13275 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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SEMA3FQ13275 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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SEMA3FQ13275 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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SEMA3FQ13275 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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SEMA3FQ13275 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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SEMA3FQ13275 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3FQ13275 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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