Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIM32Q13049 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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TRIM32Q13049 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TRIM32Q13049 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TRIM32Q13049 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TRIM32Q13049 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRIM32Q13049 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRIM32Q13049 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM32Q13049 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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