Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms