Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms