Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms