Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB1P98172 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms