Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CARD18P57730 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CARD18P57730 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CARD18P57730 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms