Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATP5EP56381 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms