Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAG2P55895 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms