Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPAP53621 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPAP53621 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPAP53621 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPAP53621 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms