Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNPDA1P46926 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms