Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP3P42574 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP3P42574 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms