Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCAP28676 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCAP28676 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCAP28676 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCAP28676 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms