Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms