Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA4P13612 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA4P13612 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms