Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL3P10147 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms