Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEFLP07196 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEFLP07196 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms