Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGB3P05106 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms