Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG13O75143 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG13O75143 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATG13O75143 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms