Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPAG9O60271 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPAG9O60271 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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