Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms