Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DENRO43583 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DENRO43583 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms