Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms