Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA3Q9Y6H8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms