Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms