Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLRF1Q9NZS2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms