Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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HOXC10Q9NYD6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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