Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms