Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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