Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms