Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC97Q96F63 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms