Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms