Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP55Q53EZ4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP55Q53EZ4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms