Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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