Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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