Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HADHQ16836 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HADHQ16836 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HADHQ16836 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HADHQ16836 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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