Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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