Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms