Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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