Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE4AQ14139 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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UBE4AQ14139 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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UBE4AQ14139 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE4AQ14139 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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