Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CAPSQ13938 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPSQ13938 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms